Protein–RNA interactions for Protein: O60279

SUSD5, Sushi domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD5O60279 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms