Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
E9PCH4 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
E9PCH4 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
E9PCH4 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
E9PCH4 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
E9PCH4 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
E9PCH4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
E9PCH4 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
E9PCH4 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
E9PCH4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
E9PCH4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
E9PCH4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
E9PCH4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
E9PCH4 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
E9PCH4 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
E9PCH4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
E9PCH4 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
E9PCH4 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
E9PCH4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
E9PCH4 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
E9PCH4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
E9PCH4 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
E9PCH4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
E9PCH4 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
E9PCH4 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
E9PCH4 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
E9PCH4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
E9PCH4 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
E9PCH4 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
E9PCH4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
E9PCH4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
E9PCH4 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
E9PCH4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
E9PCH4 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
E9PCH4 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
E9PCH4 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
E9PCH4 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
E9PCH4 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
E9PCH4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
E9PCH4 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
E9PCH4 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
E9PCH4 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
E9PCH4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
E9PCH4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
E9PCH4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
E9PCH4 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
E9PCH4 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
E9PCH4 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
E9PCH4 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
E9PCH4 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
E9PCH4 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
E9PCH4 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
E9PCH4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
E9PCH4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
E9PCH4 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
E9PCH4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
E9PCH4 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
E9PCH4 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
E9PCH4 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
E9PCH4 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
E9PCH4 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
E9PCH4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
E9PCH4 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
E9PCH4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
E9PCH4 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
E9PCH4 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
E9PCH4 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
E9PCH4 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
E9PCH4 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
E9PCH4 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
E9PCH4 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
E9PCH4 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
E9PCH4 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
E9PCH4 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
E9PCH4 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
E9PCH4 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
E9PCH4 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
E9PCH4 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
E9PCH4 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
E9PCH4 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
E9PCH4 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
E9PCH4 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
E9PCH4 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
E9PCH4 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
E9PCH4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
E9PCH4 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
E9PCH4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
E9PCH4 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
E9PCH4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
E9PCH4 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
E9PCH4 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
E9PCH4 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
E9PCH4 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
E9PCH4 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
E9PCH4 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
E9PCH4 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
E9PCH4 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
E9PCH4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
E9PCH4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
E9PCH4 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms