Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PALD1Q9ULE6 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PALD1Q9ULE6 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PALD1Q9ULE6 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PALD1Q9ULE6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PALD1Q9ULE6 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PALD1Q9ULE6 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PALD1Q9ULE6 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PALD1Q9ULE6 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PALD1Q9ULE6 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PALD1Q9ULE6 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PALD1Q9ULE6 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PALD1Q9ULE6 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PALD1Q9ULE6 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PALD1Q9ULE6 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PALD1Q9ULE6 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PALD1Q9ULE6 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PALD1Q9ULE6 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PALD1Q9ULE6 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PALD1Q9ULE6 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PALD1Q9ULE6 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PALD1Q9ULE6 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PALD1Q9ULE6 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PALD1Q9ULE6 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PALD1Q9ULE6 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PALD1Q9ULE6 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PALD1Q9ULE6 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PALD1Q9ULE6 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PALD1Q9ULE6 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PALD1Q9ULE6 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PALD1Q9ULE6 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PALD1Q9ULE6 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PALD1Q9ULE6 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PALD1Q9ULE6 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PALD1Q9ULE6 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PALD1Q9ULE6 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PALD1Q9ULE6 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PALD1Q9ULE6 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PALD1Q9ULE6 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PALD1Q9ULE6 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PALD1Q9ULE6 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PALD1Q9ULE6 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms