Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms