Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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