Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms