Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB3IPQ96QF0 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms