Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms