Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD2Q96BF3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms