Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF3C6Q969F1 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF3C6Q969F1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms