Protein–RNA interactions for Protein: Q92826

HOXB13, Homeobox protein Hox-B13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB13Q92826 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms