Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms