Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYQ5

DGCR8, Microprocessor complex subunit DGCR8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DGCR8Q8WYQ5 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.043e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 STAT5A-205ENST00000478897 550 ntTSL 414.79□□□□□ -0.043e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.043e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.043e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 KIF3C-204ENST00000455394 5462 ntTSL 1 (best)14.77□□□□□ -0.043e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.043e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 AGO2-203ENST00000518019 421 ntTSL 214.77□□□□□ -0.053e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 PC-207ENST00000528403 706 ntTSL 214.76□□□□□ -0.053e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 SH3TC1-207ENST00000503284 560 ntTSL 414.76□□□□□ -0.053e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 CRTC2-207ENST00000487235 2263 ntTSL 214.76□□□□□ -0.053e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.053e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.053e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 TLE2-218ENST00000591457 393 ntTSL 514.74□□□□□ -0.053e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.053e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.053e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 DEAF1-206ENST00000526857 567 ntTSL 314.73□□□□□ -0.053e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 PPME1-208ENST00000543525 1928 ntTSL 1 (best)14.72□□□□□ -0.053e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.053e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 AC074143.1-202ENST00000518753 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 514.71□□□□□ -0.053e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 LIMS1-205ENST00000410093 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.063e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.063e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 UBE2J2-215ENST00000477894 767 ntTSL 514.7□□□□□ -0.063e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.063e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 RECQL5-212ENST00000580707 948 ntTSL 314.69□□□□□ -0.063e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 MBNL1-207ENST00000459747 594 ntTSL 414.69□□□□□ -0.063e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.063e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.063e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.063e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 KMT5B-208ENST00000434573 585 ntTSL 414.66□□□□□ -0.063e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 SH3TC1-225ENST00000515682 4293 ntTSL 214.66□□□□□ -0.063e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 FAM86EP-202ENST00000502255 869 ntTSL 314.65□□□□□ -0.063e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 RECQL5-205ENST00000443199 3089 ntTSL 1 (best)14.64□□□□□ -0.073e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 SEC11C-203ENST00000585864 1088 ntTSL 1 (best)14.64□□□□□ -0.073e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.073e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 BSG-207ENST00000573216 545 ntTSL 414.62□□□□□ -0.077e-7■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.073e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 SCAMP4-203ENST00000411971 783 ntTSL 514.61□□□□□ -0.073e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 RBM4-201ENST00000310092 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.073e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.073e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 GPATCH2L-213ENST00000557542 446 ntTSL 414.6□□□□□ -0.073e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.073e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 ARHGAP45-208ENST00000587186 539 ntTSL 514.59□□□□□ -0.073e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.083e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.083e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.083e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 TMEM51-206ENST00000451326 766 ntTSL 314.56□□□□□ -0.083e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 LAMA5-203ENST00000370691 3160 ntTSL 1 (best)14.56□□□□□ -0.083e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.083e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.083e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 HDAC4-213ENST00000496347 995 ntTSL 314.54□□□□□ -0.083e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.083e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 PAFAH1B2-203ENST00000526888 1099 ntTSL 214.53□□□□□ -0.083e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.093e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.093e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 MRPS11-207ENST00000559323 2002 ntTSL 214.48□□□□□ -0.093e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 ZEB2-230ENST00000629955 1435 ntTSL 514.48□□□□□ -0.093e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.093e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 LAMA5-210ENST00000491036 728 ntTSL 214.47□□□□□ -0.093e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 OBSCN-207ENST00000483539 4779 ntTSL 514.47□□□□□ -0.093e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 ITFG1-204ENST00000544001 1849 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.093e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 PLIN3-201ENST00000221957 2333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.13e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 SPRYD3-203ENST00000547257 635 ntTSL 514.44□□□□□ -0.13e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.13e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.13e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.13e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 CORO7-227ENST00000575714 2978 ntTSL 514.41□□□□□ -0.13e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 INTS3-204ENST00000435409 3597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.13e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 ARHGAP45-209ENST00000587602 3875 ntTSL 214.41□□□□□ -0.13e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.13e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 G6PD-205ENST00000439227 1074 ntTSL 514.4□□□□□ -0.13e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 VOPP1-202ENST00000414113 539 ntTSL 414.39□□□□□ -0.113e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 PITPNB-204ENST00000436663 590 ntTSL 214.38□□□□□ -0.113e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 ACTN1-217ENST00000556203 564 ntTSL 314.38□□□□□ -0.113e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 ATG16L2-203ENST00000439504 3841 ntTSL 1 (best)14.37□□□□□ -0.113e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 LIMS1-210ENST00000449684 492 ntTSL 514.36□□□□□ -0.113e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.118e-7■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 FCGR2C-203ENST00000467903 1101 ntTSL 314.35□□□□□ -0.113e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 LDLRAP1-204ENST00000474283 913 ntTSL 314.32□□□□□ -0.123e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.123e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.123e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.128e-7■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.123e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 HAUS7-206ENST00000464993 851 ntTSL 214.27□□□□□ -0.133e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 AC139149.1-201ENST00000430912 361 ntTSL 314.26□□□□□ -0.133e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.133e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 SUN1-216ENST00000440380 537 ntTSL 514.25□□□□□ -0.133e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 MCM9-208ENST00000505485 825 ntTSL 414.25□□□□□ -0.133e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 TLE2-214ENST00000589364 841 ntTSL 514.24□□□□□ -0.133e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.133e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.133e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.133e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 IRAK4-213ENST00000552309 1000 ntTSL 514.2□□□□□ -0.143e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.143e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.143e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 TRIM11-203ENST00000475775 693 ntTSL 214.18□□□□□ -0.143e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 CRTC2-206ENST00000476883 467 ntTSL 514.17□□□□□ -0.143e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 TKT-214ENST00000494523 1955 ntTSL 214.16□□□□□ -0.143e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 VOPP1-213ENST00000455023 574 ntTSL 414.16□□□□□ -0.143e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.143e-6■■■■■ 50.8
DGCR8Q8WYQ5 HIVEP3-205ENST00000489103 1705 ntTSL 1 (best)14.15□□□□□ -0.143e-6■■■■■ 50.8
Retrieved 100 of 22,183 protein–RNA pairs in 166.3 ms