Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI59

KRTAP21-2, Keratin-associated protein 21-2, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-2Q3LI59 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms