Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SNCBQ16143 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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