Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NEDD8Q15843 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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