Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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EFNB3Q15768 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNB3Q15768 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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EFNB3Q15768 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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EFNB3Q15768 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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EFNB3Q15768 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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EFNB3Q15768 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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EFNB3Q15768 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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EFNB3Q15768 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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EFNB3Q15768 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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EFNB3Q15768 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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