Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PUM3Q15397 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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