Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
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