Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
STRN3Q13033 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms