Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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CNTN1Q12860 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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CNTN1Q12860 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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CNTN1Q12860 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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CNTN1Q12860 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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CNTN1Q12860 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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