Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
STX4Q12846 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
STX4Q12846 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
STX4Q12846 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
STX4Q12846 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
STX4Q12846 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
STX4Q12846 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
STX4Q12846 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
STX4Q12846 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
STX4Q12846 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
STX4Q12846 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
STX4Q12846 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
STX4Q12846 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
STX4Q12846 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
STX4Q12846 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
STX4Q12846 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
STX4Q12846 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
STX4Q12846 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
STX4Q12846 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
STX4Q12846 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
STX4Q12846 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
STX4Q12846 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
STX4Q12846 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STX4Q12846 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
STX4Q12846 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
STX4Q12846 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STX4Q12846 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STX4Q12846 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
STX4Q12846 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STX4Q12846 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STX4Q12846 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STX4Q12846 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
STX4Q12846 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STX4Q12846 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STX4Q12846 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STX4Q12846 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STX4Q12846 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
STX4Q12846 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
STX4Q12846 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
STX4Q12846 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STX4Q12846 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
STX4Q12846 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STX4Q12846 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
STX4Q12846 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
STX4Q12846 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
STX4Q12846 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
STX4Q12846 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STX4Q12846 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STX4Q12846 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
STX4Q12846 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
STX4Q12846 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STX4Q12846 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STX4Q12846 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STX4Q12846 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
STX4Q12846 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STX4Q12846 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
STX4Q12846 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
STX4Q12846 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
STX4Q12846 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
STX4Q12846 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
STX4Q12846 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
STX4Q12846 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
STX4Q12846 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
STX4Q12846 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
STX4Q12846 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
STX4Q12846 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
STX4Q12846 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
STX4Q12846 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
STX4Q12846 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
STX4Q12846 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
STX4Q12846 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
STX4Q12846 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
STX4Q12846 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
STX4Q12846 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
STX4Q12846 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
STX4Q12846 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
STX4Q12846 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
STX4Q12846 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
STX4Q12846 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
STX4Q12846 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
STX4Q12846 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
STX4Q12846 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
STX4Q12846 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
STX4Q12846 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
STX4Q12846 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
STX4Q12846 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
STX4Q12846 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
STX4Q12846 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
STX4Q12846 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
STX4Q12846 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
STX4Q12846 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
STX4Q12846 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
STX4Q12846 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
STX4Q12846 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
STX4Q12846 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
STX4Q12846 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
STX4Q12846 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
STX4Q12846 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
STX4Q12846 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
STX4Q12846 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
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