Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms