Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NUCB1Q02818 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUCB1Q02818 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms