Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms