Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSRP3P50461 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSRP3P50461 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSRP3P50461 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSRP3P50461 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSRP3P50461 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSRP3P50461 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSRP3P50461 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CSRP3P50461 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CSRP3P50461 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSRP3P50461 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSRP3P50461 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSRP3P50461 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSRP3P50461 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSRP3P50461 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSRP3P50461 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSRP3P50461 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSRP3P50461 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSRP3P50461 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSRP3P50461 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms