Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DDIT3P35638 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
DDIT3P35638 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
DDIT3P35638 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
DDIT3P35638 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
DDIT3P35638 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
DDIT3P35638 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
DDIT3P35638 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
DDIT3P35638 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
DDIT3P35638 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
DDIT3P35638 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
DDIT3P35638 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
DDIT3P35638 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
DDIT3P35638 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DDIT3P35638 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DDIT3P35638 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DDIT3P35638 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms