Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMA5P28066 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms