Protein–RNA interactions for Protein: P10144

GZMB, Granzyme B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GZMBP10144 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
GZMBP10144 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GZMBP10144 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GZMBP10144 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GZMBP10144 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GZMBP10144 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GZMBP10144 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GZMBP10144 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GZMBP10144 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GZMBP10144 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GZMBP10144 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GZMBP10144 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GZMBP10144 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GZMBP10144 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GZMBP10144 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GZMBP10144 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GZMBP10144 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GZMBP10144 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GZMBP10144 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
GZMBP10144 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
GZMBP10144 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GZMBP10144 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
GZMBP10144 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GZMBP10144 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GZMBP10144 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GZMBP10144 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GZMBP10144 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GZMBP10144 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GZMBP10144 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GZMBP10144 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GZMBP10144 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GZMBP10144 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GZMBP10144 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GZMBP10144 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GZMBP10144 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GZMBP10144 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GZMBP10144 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GZMBP10144 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GZMBP10144 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GZMBP10144 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
GZMBP10144 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
GZMBP10144 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
GZMBP10144 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GZMBP10144 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GZMBP10144 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GZMBP10144 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
GZMBP10144 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GZMBP10144 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
GZMBP10144 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GZMBP10144 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GZMBP10144 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GZMBP10144 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GZMBP10144 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GZMBP10144 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GZMBP10144 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GZMBP10144 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GZMBP10144 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GZMBP10144 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GZMBP10144 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GZMBP10144 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GZMBP10144 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GZMBP10144 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GZMBP10144 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GZMBP10144 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GZMBP10144 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
GZMBP10144 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GZMBP10144 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
GZMBP10144 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GZMBP10144 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GZMBP10144 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GZMBP10144 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
GZMBP10144 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GZMBP10144 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
GZMBP10144 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GZMBP10144 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GZMBP10144 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GZMBP10144 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GZMBP10144 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GZMBP10144 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GZMBP10144 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GZMBP10144 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GZMBP10144 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GZMBP10144 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GZMBP10144 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GZMBP10144 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GZMBP10144 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GZMBP10144 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GZMBP10144 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GZMBP10144 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GZMBP10144 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GZMBP10144 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GZMBP10144 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GZMBP10144 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GZMBP10144 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GZMBP10144 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GZMBP10144 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GZMBP10144 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GZMBP10144 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GZMBP10144 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GZMBP10144 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms