Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA1P02647 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA1P02647 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA1P02647 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA1P02647 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA1P02647 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA1P02647 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA1P02647 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA1P02647 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA1P02647 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA1P02647 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA1P02647 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA1P02647 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA1P02647 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA1P02647 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA1P02647 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA1P02647 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA1P02647 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA1P02647 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA1P02647 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOA1P02647 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOA1P02647 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOA1P02647 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOA1P02647 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOA1P02647 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOA1P02647 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOA1P02647 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOA1P02647 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOA1P02647 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOA1P02647 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOA1P02647 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
APOA1P02647 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOA1P02647 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOA1P02647 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOA1P02647 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOA1P02647 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOA1P02647 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOA1P02647 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOA1P02647 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOA1P02647 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOA1P02647 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOA1P02647 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOA1P02647 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
APOA1P02647 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOA1P02647 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOA1P02647 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOA1P02647 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOA1P02647 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOA1P02647 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOA1P02647 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOA1P02647 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOA1P02647 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOA1P02647 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOA1P02647 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
APOA1P02647 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOA1P02647 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOA1P02647 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOA1P02647 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
APOA1P02647 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOA1P02647 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOA1P02647 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOA1P02647 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOA1P02647 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOA1P02647 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOA1P02647 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOA1P02647 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOA1P02647 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOA1P02647 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOA1P02647 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOA1P02647 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOA1P02647 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOA1P02647 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOA1P02647 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOA1P02647 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOA1P02647 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOA1P02647 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
APOA1P02647 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOA1P02647 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOA1P02647 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOA1P02647 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOA1P02647 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOA1P02647 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOA1P02647 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOA1P02647 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOA1P02647 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOA1P02647 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOA1P02647 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOA1P02647 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOA1P02647 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOA1P02647 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA1P02647 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA1P02647 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA1P02647 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA1P02647 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA1P02647 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA1P02647 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA1P02647 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA1P02647 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA1P02647 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA1P02647 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms