Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.093e-6■■■■■ 121.2
SF3B1O75533 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -03e-6■■■■■ 121.2
SF3B1O75533 DAG1-207ENST00000431960 549 ntTSL 414.12□□□□□ -0.156e-8■■■■■ 121.2
SF3B1O75533 DAG1-218ENST00000515359 5576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.356e-8■■■■■ 121.2
SF3B1O75533 DAG1-214ENST00000469139 561 ntTSL 412.22□□□□□ -0.456e-8■■■■■ 121.2
SF3B1O75533 ZNRF1-203ENST00000564320 607 ntTSL 39.53□□□□□ -0.881e-6■■■■■ 121.2
SF3B1O75533 ZNRF1-209ENST00000568511 485 ntTSL 49.51□□□□□ -0.891e-6■■■■■ 121.2
SF3B1O75533 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.14e-6■■■■■ 121.2
SF3B1O75533 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.064e-6■■■■■ 121.2
SF3B1O75533 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.034e-6■■■■■ 121.2
SF3B1O75533 MROH1-205ENST00000527552 5832 ntTSL 1 (best)12.95□□□□□ -0.344e-6■■■■■ 121.2
SF3B1O75533 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.642e-7■■■■■ 121.2
SF3B1O75533 MED16-209ENST00000592943 1628 ntTSL 1 (best)18.91■□□□□ 0.622e-7■■■■■ 121.2
SF3B1O75533 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.532e-7■■■■■ 121.2
SF3B1O75533 MED16-212ENST00000607471 2004 ntTSL 1 (best)16.29■□□□□ 0.22e-7■■■■■ 121.2
SF3B1O75533 MED16-205ENST00000586017 1403 ntTSL 1 (best)16.18■□□□□ 0.182e-7■■■■■ 121.2
SF3B1O75533 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.132e-7■■■■■ 121.2
SF3B1O75533 MED16-211ENST00000606828 599 ntTSL 1 (best)14.97□□□□□ -0.012e-7■■■■■ 121.2
SF3B1O75533 LMNA-223ENST00000515459 757 ntTSL 517.48■□□□□ 0.391e-6■■■■■ 121.1
SF3B1O75533 LMNA-220ENST00000504687 546 ntTSL 413.89□□□□□ -0.191e-6■■■■■ 121.1
SF3B1O75533 FAM122C-206ENST00000470657 783 ntTSL 510.07□□□□□ -0.84e-7■■■■■ 121.1
SF3B1O75533 FAM122C-202ENST00000370785 1344 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.074e-7■■■■■ 121.1
SF3B1O75533 FAM122C-201ENST00000370784 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.174e-7■■■■■ 121.1
SF3B1O75533 TM9SF2-201ENST00000376387 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.511e-6■■■■■ 121.1
SF3B1O75533 MTOR-201ENST00000361445 8677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.793e-6■■■■■ 121
SF3B1O75533 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.213e-6■■■■■ 121
SF3B1O75533 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.713e-6■■■■■ 121
SF3B1O75533 TNRC6B-203ENST00000402203 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.258e-7■■■■■ 121
SF3B1O75533 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.521e-6■■■■■ 120.9
SF3B1O75533 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.251e-6■■■■■ 120.9
SF3B1O75533 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.151e-6■■■■■ 120.9
SF3B1O75533 LRRFIP2-203ENST00000396428 1791 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.661e-6■■■■■ 120.9
SF3B1O75533 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.261e-6■■■■■ 120.9
SF3B1O75533 CDRT4-203ENST00000524205 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 211.23□□□□□ -0.612e-6■■■■■ 120.7
SF3B1O75533 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.535e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.895e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.832e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.832e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.832e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 ST6GALNAC6-207ENST00000463086 505 ntTSL 526.39■■□□□ 1.815e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.765e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.755e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.755e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.725e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 ST6GALNAC6-209ENST00000480417 777 ntTSL 225.76■■□□□ 1.715e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 GPRC5B-204ENST00000562469 818 ntTSL 425.39■■□□□ 1.665e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.615e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.555e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.555e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 CDK11B-202ENST00000341028 881 ntTSL 224.5■■□□□ 1.513e-16■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 ATXN10-211ENST00000498009 873 ntTSL 524.04■■□□□ 1.445e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 TCIRG1-211ENST00000530449 525 ntTSL 1 (best)23.84■■□□□ 1.415e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 APOE-204ENST00000446996 737 ntTSL 223.83■■□□□ 1.45e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.395e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.382e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.372e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 SEMA3F-207ENST00000450338 1693 ntTSL 523.54■■□□□ 1.365e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.345e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 RCCD1-208ENST00000557266 2110 ntTSL 1 (best)23.24■■□□□ 1.315e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 TULP4-207ENST00000620026 680 ntTSL 423.2■■□□□ 1.31e-7■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 CCDC137-204ENST00000574107 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 323.08■■□□□ 1.295e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 ST6GALNAC6-208ENST00000478319 452 ntTSL 522.66■■□□□ 1.225e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.215e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.195e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 CCDC137-206ENST00000575223 1888 ntTSL 522.48■■□□□ 1.195e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 PKD1-221ENST00000488185 737 ntTSL 522.41■■□□□ 1.185e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 PKD1-237ENST00000569983 722 ntTSL 522.14■■□□□ 1.145e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 APOE-203ENST00000434152 864 ntTSL 222.03■■□□□ 1.125e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 RNF14-211ENST00000507291 473 ntTSL 521.99■■□□□ 1.115e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.095e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 RCCD1-205ENST00000556333 735 ntTSL 1 (best)21.87■■□□□ 1.095e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 ST6GALNAC6-212ENST00000485320 2357 ntTSL 521.66■■□□□ 1.065e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 SLC26A6-214ENST00000462009 825 ntTSL 321.61■■□□□ 1.055e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 ANAPC2-206ENST00000493730 597 ntTSL 321.58■■□□□ 1.055e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.045e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 PITRM1-211ENST00000490510 778 ntTSL 221.08■□□□□ 0.975e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.965e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.943e-8■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.925e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 FAM207A-204ENST00000479127 759 ntTSL 320.77■□□□□ 0.913e-7■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 RNF103-203ENST00000465629 2108 ntTSL 1 (best)20.72■□□□□ 0.915e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 ST6GALNAC6-214ENST00000494611 474 ntTSL 520.65■□□□□ 0.95e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.865e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 LYPLA1-209ENST00000520896 578 ntTSL 420.4■□□□□ 0.865e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.855e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 ADAM8-203ENST00000463298 1122 ntTSL 520.29■□□□□ 0.847e-9■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 GPRC5B-207ENST00000568214 568 ntTSL 420.28■□□□□ 0.845e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 PKD1-230ENST00000565639 1976 ntTSL 520.24■□□□□ 0.835e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 DRG1-202ENST00000416465 612 ntTSL 520.18■□□□□ 0.825e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 PHF20L1-202ENST00000315808 2226 ntTSL 1 (best)20.17■□□□□ 0.825e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.85e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.795e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 ANAPC2-205ENST00000487917 1972 ntTSL 219.96■□□□□ 0.795e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 RAB43-206ENST00000457077 574 ntTSL 419.96■□□□□ 0.795e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 ANAPC2-204ENST00000485970 341 ntTSL 219.9■□□□□ 0.785e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 TCIRG1-212ENST00000530802 223 ntTSL 1 (best)19.9■□□□□ 0.785e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 PNPLA6-210ENST00000595176 999 ntTSL 319.76■□□□□ 0.755e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 TRIM41-203ENST00000503114 1904 ntTSL 1 (best)19.67■□□□□ 0.741e-12■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 GPRC5B-206ENST00000566822 763 ntTSL 219.61■□□□□ 0.735e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 EML4-208ENST00000482660 584 ntTSL 419.59■□□□□ 0.732e-6■■■■■ 120.6
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 1790.9 ms