Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DENRO43583 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DENRO43583 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DENRO43583 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DENRO43583 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DENRO43583 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DENRO43583 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DENRO43583 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DENRO43583 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DENRO43583 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DENRO43583 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DENRO43583 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DENRO43583 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DENRO43583 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DENRO43583 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DENRO43583 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DENRO43583 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DENRO43583 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DENRO43583 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DENRO43583 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DENRO43583 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DENRO43583 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DENRO43583 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DENRO43583 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DENRO43583 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DENRO43583 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DENRO43583 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DENRO43583 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DENRO43583 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DENRO43583 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DENRO43583 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DENRO43583 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DENRO43583 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DENRO43583 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DENRO43583 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DENRO43583 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DENRO43583 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DENRO43583 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DENRO43583 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DENRO43583 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DENRO43583 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DENRO43583 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DENRO43583 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DENRO43583 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DENRO43583 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DENRO43583 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DENRO43583 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DENRO43583 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DENRO43583 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DENRO43583 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DENRO43583 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DENRO43583 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DENRO43583 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DENRO43583 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DENRO43583 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DENRO43583 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DENRO43583 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DENRO43583 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DENRO43583 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DENRO43583 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DENRO43583 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DENRO43583 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DENRO43583 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DENRO43583 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DENRO43583 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DENRO43583 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DENRO43583 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DENRO43583 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DENRO43583 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DENRO43583 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DENRO43583 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DENRO43583 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DENRO43583 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DENRO43583 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DENRO43583 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DENRO43583 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DENRO43583 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DENRO43583 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DENRO43583 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DENRO43583 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DENRO43583 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DENRO43583 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DENRO43583 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DENRO43583 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DENRO43583 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DENRO43583 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DENRO43583 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DENRO43583 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DENRO43583 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DENRO43583 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DENRO43583 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DENRO43583 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DENRO43583 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DENRO43583 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DENRO43583 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DENRO43583 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DENRO43583 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DENRO43583 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DENRO43583 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DENRO43583 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms