Protein–RNA interactions for Protein: D3W0D1

KLRF2, Killer cell lectin-like receptor subfamily F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLRF2D3W0D1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLRF2D3W0D1 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
KLRF2D3W0D1 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
KLRF2D3W0D1 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
KLRF2D3W0D1 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLRF2D3W0D1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLRF2D3W0D1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLRF2D3W0D1 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms