Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6K1

DNMT3A, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3AQ9Y6K1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNMT3AQ9Y6K1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNMT3AQ9Y6K1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNMT3AQ9Y6K1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNMT3AQ9Y6K1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNMT3AQ9Y6K1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNMT3AQ9Y6K1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNMT3AQ9Y6K1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNMT3AQ9Y6K1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNMT3AQ9Y6K1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNMT3AQ9Y6K1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNMT3AQ9Y6K1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNMT3AQ9Y6K1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DNMT3AQ9Y6K1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNMT3AQ9Y6K1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNMT3AQ9Y6K1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNMT3AQ9Y6K1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DNMT3AQ9Y6K1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNMT3AQ9Y6K1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNMT3AQ9Y6K1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNMT3AQ9Y6K1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNMT3AQ9Y6K1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNMT3AQ9Y6K1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNMT3AQ9Y6K1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNMT3AQ9Y6K1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNMT3AQ9Y6K1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNMT3AQ9Y6K1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNMT3AQ9Y6K1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNMT3AQ9Y6K1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNMT3AQ9Y6K1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNMT3AQ9Y6K1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNMT3AQ9Y6K1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNMT3AQ9Y6K1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNMT3AQ9Y6K1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNMT3AQ9Y6K1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNMT3AQ9Y6K1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNMT3AQ9Y6K1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNMT3AQ9Y6K1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNMT3AQ9Y6K1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNMT3AQ9Y6K1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNMT3AQ9Y6K1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNMT3AQ9Y6K1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNMT3AQ9Y6K1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNMT3AQ9Y6K1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNMT3AQ9Y6K1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DNMT3AQ9Y6K1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNMT3AQ9Y6K1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNMT3AQ9Y6K1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNMT3AQ9Y6K1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNMT3AQ9Y6K1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNMT3AQ9Y6K1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNMT3AQ9Y6K1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DNMT3AQ9Y6K1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DNMT3AQ9Y6K1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNMT3AQ9Y6K1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNMT3AQ9Y6K1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNMT3AQ9Y6K1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNMT3AQ9Y6K1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DNMT3AQ9Y6K1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNMT3AQ9Y6K1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
DNMT3AQ9Y6K1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DNMT3AQ9Y6K1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DNMT3AQ9Y6K1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DNMT3AQ9Y6K1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT3AQ9Y6K1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT3AQ9Y6K1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT3AQ9Y6K1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT3AQ9Y6K1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT3AQ9Y6K1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT3AQ9Y6K1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT3AQ9Y6K1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT3AQ9Y6K1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNMT3AQ9Y6K1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNMT3AQ9Y6K1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNMT3AQ9Y6K1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DNMT3AQ9Y6K1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNMT3AQ9Y6K1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNMT3AQ9Y6K1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNMT3AQ9Y6K1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNMT3AQ9Y6K1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNMT3AQ9Y6K1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNMT3AQ9Y6K1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNMT3AQ9Y6K1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNMT3AQ9Y6K1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNMT3AQ9Y6K1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNMT3AQ9Y6K1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNMT3AQ9Y6K1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNMT3AQ9Y6K1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNMT3AQ9Y6K1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNMT3AQ9Y6K1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNMT3AQ9Y6K1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNMT3AQ9Y6K1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNMT3AQ9Y6K1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNMT3AQ9Y6K1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNMT3AQ9Y6K1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNMT3AQ9Y6K1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNMT3AQ9Y6K1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNMT3AQ9Y6K1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNMT3AQ9Y6K1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNMT3AQ9Y6K1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms