Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
GJA3Q9Y6H8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
GJA3Q9Y6H8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GJA3Q9Y6H8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
GJA3Q9Y6H8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
GJA3Q9Y6H8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GJA3Q9Y6H8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GJA3Q9Y6H8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GJA3Q9Y6H8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GJA3Q9Y6H8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GJA3Q9Y6H8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GJA3Q9Y6H8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GJA3Q9Y6H8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GJA3Q9Y6H8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GJA3Q9Y6H8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GJA3Q9Y6H8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
GJA3Q9Y6H8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GJA3Q9Y6H8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GJA3Q9Y6H8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
GJA3Q9Y6H8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GJA3Q9Y6H8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
GJA3Q9Y6H8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
GJA3Q9Y6H8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
GJA3Q9Y6H8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
GJA3Q9Y6H8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GJA3Q9Y6H8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GJA3Q9Y6H8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
GJA3Q9Y6H8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
GJA3Q9Y6H8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
GJA3Q9Y6H8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GJA3Q9Y6H8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
GJA3Q9Y6H8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GJA3Q9Y6H8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
GJA3Q9Y6H8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
GJA3Q9Y6H8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GJA3Q9Y6H8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GJA3Q9Y6H8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GJA3Q9Y6H8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
GJA3Q9Y6H8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
GJA3Q9Y6H8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
GJA3Q9Y6H8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GJA3Q9Y6H8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GJA3Q9Y6H8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GJA3Q9Y6H8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GJA3Q9Y6H8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GJA3Q9Y6H8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GJA3Q9Y6H8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GJA3Q9Y6H8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GJA3Q9Y6H8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GJA3Q9Y6H8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GJA3Q9Y6H8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GJA3Q9Y6H8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GJA3Q9Y6H8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GJA3Q9Y6H8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
GJA3Q9Y6H8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
GJA3Q9Y6H8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
GJA3Q9Y6H8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
GJA3Q9Y6H8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
GJA3Q9Y6H8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GJA3Q9Y6H8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
GJA3Q9Y6H8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GJA3Q9Y6H8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GJA3Q9Y6H8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GJA3Q9Y6H8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GJA3Q9Y6H8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GJA3Q9Y6H8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
GJA3Q9Y6H8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
GJA3Q9Y6H8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
GJA3Q9Y6H8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
GJA3Q9Y6H8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GJA3Q9Y6H8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
GJA3Q9Y6H8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
GJA3Q9Y6H8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
GJA3Q9Y6H8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GJA3Q9Y6H8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
GJA3Q9Y6H8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GJA3Q9Y6H8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
GJA3Q9Y6H8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GJA3Q9Y6H8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GJA3Q9Y6H8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GJA3Q9Y6H8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
GJA3Q9Y6H8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GJA3Q9Y6H8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GJA3Q9Y6H8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GJA3Q9Y6H8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GJA3Q9Y6H8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GJA3Q9Y6H8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
GJA3Q9Y6H8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GJA3Q9Y6H8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GJA3Q9Y6H8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GJA3Q9Y6H8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
GJA3Q9Y6H8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GJA3Q9Y6H8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GJA3Q9Y6H8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GJA3Q9Y6H8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GJA3Q9Y6H8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GJA3Q9Y6H8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GJA3Q9Y6H8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GJA3Q9Y6H8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GJA3Q9Y6H8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms