Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00312Q9Y6C7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00312Q9Y6C7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00312Q9Y6C7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00312Q9Y6C7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00312Q9Y6C7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00312Q9Y6C7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00312Q9Y6C7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00312Q9Y6C7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00312Q9Y6C7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00312Q9Y6C7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00312Q9Y6C7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00312Q9Y6C7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00312Q9Y6C7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00312Q9Y6C7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00312Q9Y6C7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00312Q9Y6C7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00312Q9Y6C7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
LINC00312Q9Y6C7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00312Q9Y6C7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00312Q9Y6C7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00312Q9Y6C7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00312Q9Y6C7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00312Q9Y6C7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00312Q9Y6C7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00312Q9Y6C7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00312Q9Y6C7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00312Q9Y6C7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00312Q9Y6C7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00312Q9Y6C7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00312Q9Y6C7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00312Q9Y6C7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00312Q9Y6C7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00312Q9Y6C7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00312Q9Y6C7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00312Q9Y6C7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00312Q9Y6C7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00312Q9Y6C7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00312Q9Y6C7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00312Q9Y6C7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00312Q9Y6C7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00312Q9Y6C7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00312Q9Y6C7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00312Q9Y6C7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00312Q9Y6C7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00312Q9Y6C7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00312Q9Y6C7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00312Q9Y6C7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00312Q9Y6C7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00312Q9Y6C7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00312Q9Y6C7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00312Q9Y6C7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00312Q9Y6C7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00312Q9Y6C7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00312Q9Y6C7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00312Q9Y6C7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00312Q9Y6C7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00312Q9Y6C7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00312Q9Y6C7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00312Q9Y6C7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00312Q9Y6C7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00312Q9Y6C7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00312Q9Y6C7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00312Q9Y6C7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00312Q9Y6C7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00312Q9Y6C7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00312Q9Y6C7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00312Q9Y6C7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00312Q9Y6C7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00312Q9Y6C7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00312Q9Y6C7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00312Q9Y6C7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00312Q9Y6C7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00312Q9Y6C7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00312Q9Y6C7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00312Q9Y6C7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00312Q9Y6C7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00312Q9Y6C7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00312Q9Y6C7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00312Q9Y6C7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00312Q9Y6C7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00312Q9Y6C7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00312Q9Y6C7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00312Q9Y6C7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00312Q9Y6C7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00312Q9Y6C7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00312Q9Y6C7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00312Q9Y6C7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00312Q9Y6C7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00312Q9Y6C7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00312Q9Y6C7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00312Q9Y6C7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00312Q9Y6C7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00312Q9Y6C7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00312Q9Y6C7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00312Q9Y6C7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00312Q9Y6C7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00312Q9Y6C7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00312Q9Y6C7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00312Q9Y6C7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms