Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX8Q9Y5X2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX8Q9Y5X2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX8Q9Y5X2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX8Q9Y5X2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX8Q9Y5X2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX8Q9Y5X2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX8Q9Y5X2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX8Q9Y5X2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX8Q9Y5X2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX8Q9Y5X2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX8Q9Y5X2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX8Q9Y5X2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX8Q9Y5X2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX8Q9Y5X2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX8Q9Y5X2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX8Q9Y5X2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX8Q9Y5X2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNX8Q9Y5X2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX8Q9Y5X2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX8Q9Y5X2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX8Q9Y5X2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX8Q9Y5X2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX8Q9Y5X2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX8Q9Y5X2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX8Q9Y5X2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX8Q9Y5X2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX8Q9Y5X2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX8Q9Y5X2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX8Q9Y5X2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX8Q9Y5X2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX8Q9Y5X2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX8Q9Y5X2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX8Q9Y5X2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX8Q9Y5X2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX8Q9Y5X2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX8Q9Y5X2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX8Q9Y5X2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX8Q9Y5X2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX8Q9Y5X2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX8Q9Y5X2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX8Q9Y5X2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX8Q9Y5X2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX8Q9Y5X2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX8Q9Y5X2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX8Q9Y5X2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX8Q9Y5X2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX8Q9Y5X2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX8Q9Y5X2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX8Q9Y5X2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX8Q9Y5X2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX8Q9Y5X2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX8Q9Y5X2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX8Q9Y5X2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX8Q9Y5X2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX8Q9Y5X2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX8Q9Y5X2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX8Q9Y5X2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX8Q9Y5X2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX8Q9Y5X2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX8Q9Y5X2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX8Q9Y5X2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX8Q9Y5X2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX8Q9Y5X2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX8Q9Y5X2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX8Q9Y5X2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX8Q9Y5X2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX8Q9Y5X2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX8Q9Y5X2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX8Q9Y5X2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX8Q9Y5X2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX8Q9Y5X2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX8Q9Y5X2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX8Q9Y5X2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX8Q9Y5X2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX8Q9Y5X2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX8Q9Y5X2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX8Q9Y5X2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX8Q9Y5X2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX8Q9Y5X2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX8Q9Y5X2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX8Q9Y5X2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX8Q9Y5X2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX8Q9Y5X2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX8Q9Y5X2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX8Q9Y5X2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX8Q9Y5X2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX8Q9Y5X2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX8Q9Y5X2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX8Q9Y5X2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX8Q9Y5X2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX8Q9Y5X2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX8Q9Y5X2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX8Q9Y5X2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX8Q9Y5X2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX8Q9Y5X2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX8Q9Y5X2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX8Q9Y5X2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX8Q9Y5X2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX8Q9Y5X2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms