Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X0

SNX10, Sorting nexin-10, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX10Q9Y5X0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX10Q9Y5X0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX10Q9Y5X0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX10Q9Y5X0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX10Q9Y5X0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX10Q9Y5X0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX10Q9Y5X0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX10Q9Y5X0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX10Q9Y5X0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX10Q9Y5X0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX10Q9Y5X0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX10Q9Y5X0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX10Q9Y5X0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX10Q9Y5X0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX10Q9Y5X0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX10Q9Y5X0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX10Q9Y5X0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX10Q9Y5X0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX10Q9Y5X0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX10Q9Y5X0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX10Q9Y5X0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX10Q9Y5X0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX10Q9Y5X0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX10Q9Y5X0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX10Q9Y5X0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX10Q9Y5X0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX10Q9Y5X0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX10Q9Y5X0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX10Q9Y5X0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX10Q9Y5X0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX10Q9Y5X0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX10Q9Y5X0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX10Q9Y5X0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX10Q9Y5X0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX10Q9Y5X0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX10Q9Y5X0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX10Q9Y5X0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX10Q9Y5X0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX10Q9Y5X0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX10Q9Y5X0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX10Q9Y5X0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX10Q9Y5X0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNX10Q9Y5X0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SNX10Q9Y5X0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNX10Q9Y5X0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
SNX10Q9Y5X0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX10Q9Y5X0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX10Q9Y5X0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX10Q9Y5X0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX10Q9Y5X0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX10Q9Y5X0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX10Q9Y5X0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX10Q9Y5X0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX10Q9Y5X0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX10Q9Y5X0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX10Q9Y5X0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX10Q9Y5X0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX10Q9Y5X0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX10Q9Y5X0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX10Q9Y5X0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX10Q9Y5X0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX10Q9Y5X0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX10Q9Y5X0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX10Q9Y5X0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX10Q9Y5X0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX10Q9Y5X0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX10Q9Y5X0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX10Q9Y5X0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX10Q9Y5X0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX10Q9Y5X0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX10Q9Y5X0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX10Q9Y5X0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX10Q9Y5X0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX10Q9Y5X0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX10Q9Y5X0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX10Q9Y5X0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX10Q9Y5X0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX10Q9Y5X0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX10Q9Y5X0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX10Q9Y5X0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX10Q9Y5X0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX10Q9Y5X0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX10Q9Y5X0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX10Q9Y5X0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX10Q9Y5X0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX10Q9Y5X0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX10Q9Y5X0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX10Q9Y5X0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX10Q9Y5X0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX10Q9Y5X0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX10Q9Y5X0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX10Q9Y5X0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX10Q9Y5X0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX10Q9Y5X0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX10Q9Y5X0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX10Q9Y5X0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX10Q9Y5X0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX10Q9Y5X0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX10Q9Y5X0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX10Q9Y5X0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms