Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I7

CLDN16, Claudin-16, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN16Q9Y5I7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN16Q9Y5I7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN16Q9Y5I7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN16Q9Y5I7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN16Q9Y5I7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN16Q9Y5I7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN16Q9Y5I7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN16Q9Y5I7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN16Q9Y5I7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN16Q9Y5I7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN16Q9Y5I7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN16Q9Y5I7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN16Q9Y5I7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN16Q9Y5I7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN16Q9Y5I7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN16Q9Y5I7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN16Q9Y5I7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN16Q9Y5I7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN16Q9Y5I7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN16Q9Y5I7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN16Q9Y5I7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN16Q9Y5I7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN16Q9Y5I7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN16Q9Y5I7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN16Q9Y5I7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN16Q9Y5I7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN16Q9Y5I7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN16Q9Y5I7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CLDN16Q9Y5I7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN16Q9Y5I7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN16Q9Y5I7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN16Q9Y5I7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN16Q9Y5I7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN16Q9Y5I7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN16Q9Y5I7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN16Q9Y5I7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN16Q9Y5I7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN16Q9Y5I7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN16Q9Y5I7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN16Q9Y5I7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN16Q9Y5I7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN16Q9Y5I7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN16Q9Y5I7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN16Q9Y5I7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN16Q9Y5I7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN16Q9Y5I7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN16Q9Y5I7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN16Q9Y5I7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN16Q9Y5I7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN16Q9Y5I7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN16Q9Y5I7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN16Q9Y5I7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN16Q9Y5I7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN16Q9Y5I7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN16Q9Y5I7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN16Q9Y5I7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN16Q9Y5I7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN16Q9Y5I7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN16Q9Y5I7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN16Q9Y5I7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN16Q9Y5I7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN16Q9Y5I7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN16Q9Y5I7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN16Q9Y5I7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN16Q9Y5I7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN16Q9Y5I7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN16Q9Y5I7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN16Q9Y5I7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN16Q9Y5I7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN16Q9Y5I7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN16Q9Y5I7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN16Q9Y5I7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN16Q9Y5I7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN16Q9Y5I7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN16Q9Y5I7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN16Q9Y5I7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN16Q9Y5I7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN16Q9Y5I7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN16Q9Y5I7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN16Q9Y5I7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN16Q9Y5I7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN16Q9Y5I7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN16Q9Y5I7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN16Q9Y5I7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN16Q9Y5I7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN16Q9Y5I7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN16Q9Y5I7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN16Q9Y5I7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLDN16Q9Y5I7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLDN16Q9Y5I7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN16Q9Y5I7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN16Q9Y5I7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN16Q9Y5I7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN16Q9Y5I7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN16Q9Y5I7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN16Q9Y5I7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN16Q9Y5I7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN16Q9Y5I7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN16Q9Y5I7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN16Q9Y5I7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms