Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y548

YIPF1, Protein YIPF1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF1Q9Y548 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
YIPF1Q9Y548 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
YIPF1Q9Y548 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
YIPF1Q9Y548 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
YIPF1Q9Y548 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
YIPF1Q9Y548 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
YIPF1Q9Y548 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
YIPF1Q9Y548 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
YIPF1Q9Y548 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
YIPF1Q9Y548 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
YIPF1Q9Y548 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
YIPF1Q9Y548 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
YIPF1Q9Y548 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
YIPF1Q9Y548 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
YIPF1Q9Y548 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
YIPF1Q9Y548 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
YIPF1Q9Y548 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
YIPF1Q9Y548 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
YIPF1Q9Y548 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
YIPF1Q9Y548 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
YIPF1Q9Y548 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
YIPF1Q9Y548 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
YIPF1Q9Y548 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
YIPF1Q9Y548 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
YIPF1Q9Y548 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
YIPF1Q9Y548 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
YIPF1Q9Y548 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
YIPF1Q9Y548 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
YIPF1Q9Y548 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
YIPF1Q9Y548 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
YIPF1Q9Y548 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
YIPF1Q9Y548 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
YIPF1Q9Y548 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
YIPF1Q9Y548 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
YIPF1Q9Y548 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
YIPF1Q9Y548 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
YIPF1Q9Y548 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
YIPF1Q9Y548 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
YIPF1Q9Y548 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
YIPF1Q9Y548 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
YIPF1Q9Y548 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
YIPF1Q9Y548 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
YIPF1Q9Y548 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
YIPF1Q9Y548 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
YIPF1Q9Y548 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
YIPF1Q9Y548 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
YIPF1Q9Y548 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
YIPF1Q9Y548 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
YIPF1Q9Y548 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
YIPF1Q9Y548 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
YIPF1Q9Y548 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
YIPF1Q9Y548 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
YIPF1Q9Y548 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
YIPF1Q9Y548 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
YIPF1Q9Y548 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
YIPF1Q9Y548 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
YIPF1Q9Y548 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
YIPF1Q9Y548 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
YIPF1Q9Y548 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
YIPF1Q9Y548 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
YIPF1Q9Y548 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
YIPF1Q9Y548 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
YIPF1Q9Y548 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
YIPF1Q9Y548 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
YIPF1Q9Y548 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
YIPF1Q9Y548 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
YIPF1Q9Y548 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
YIPF1Q9Y548 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
YIPF1Q9Y548 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
YIPF1Q9Y548 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
YIPF1Q9Y548 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
YIPF1Q9Y548 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
YIPF1Q9Y548 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
YIPF1Q9Y548 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
YIPF1Q9Y548 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
YIPF1Q9Y548 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
YIPF1Q9Y548 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
YIPF1Q9Y548 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
YIPF1Q9Y548 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
YIPF1Q9Y548 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
YIPF1Q9Y548 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
YIPF1Q9Y548 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
YIPF1Q9Y548 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
YIPF1Q9Y548 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
YIPF1Q9Y548 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
YIPF1Q9Y548 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
YIPF1Q9Y548 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
YIPF1Q9Y548 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
YIPF1Q9Y548 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
YIPF1Q9Y548 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
YIPF1Q9Y548 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
YIPF1Q9Y548 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
YIPF1Q9Y548 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
YIPF1Q9Y548 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
YIPF1Q9Y548 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
YIPF1Q9Y548 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
YIPF1Q9Y548 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
YIPF1Q9Y548 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
YIPF1Q9Y548 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
YIPF1Q9Y548 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms