Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y466

NR2E1, Nuclear receptor subfamily 2 group E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2E1Q9Y466 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NR2E1Q9Y466 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NR2E1Q9Y466 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NR2E1Q9Y466 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NR2E1Q9Y466 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NR2E1Q9Y466 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NR2E1Q9Y466 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NR2E1Q9Y466 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NR2E1Q9Y466 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NR2E1Q9Y466 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NR2E1Q9Y466 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NR2E1Q9Y466 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NR2E1Q9Y466 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NR2E1Q9Y466 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NR2E1Q9Y466 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NR2E1Q9Y466 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NR2E1Q9Y466 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NR2E1Q9Y466 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NR2E1Q9Y466 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NR2E1Q9Y466 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NR2E1Q9Y466 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NR2E1Q9Y466 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NR2E1Q9Y466 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NR2E1Q9Y466 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NR2E1Q9Y466 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NR2E1Q9Y466 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NR2E1Q9Y466 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NR2E1Q9Y466 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NR2E1Q9Y466 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NR2E1Q9Y466 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NR2E1Q9Y466 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NR2E1Q9Y466 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NR2E1Q9Y466 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NR2E1Q9Y466 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NR2E1Q9Y466 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NR2E1Q9Y466 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NR2E1Q9Y466 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NR2E1Q9Y466 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NR2E1Q9Y466 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NR2E1Q9Y466 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NR2E1Q9Y466 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NR2E1Q9Y466 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NR2E1Q9Y466 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NR2E1Q9Y466 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NR2E1Q9Y466 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NR2E1Q9Y466 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NR2E1Q9Y466 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NR2E1Q9Y466 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NR2E1Q9Y466 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NR2E1Q9Y466 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NR2E1Q9Y466 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NR2E1Q9Y466 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NR2E1Q9Y466 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NR2E1Q9Y466 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NR2E1Q9Y466 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NR2E1Q9Y466 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NR2E1Q9Y466 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NR2E1Q9Y466 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NR2E1Q9Y466 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NR2E1Q9Y466 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NR2E1Q9Y466 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NR2E1Q9Y466 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NR2E1Q9Y466 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NR2E1Q9Y466 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NR2E1Q9Y466 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NR2E1Q9Y466 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NR2E1Q9Y466 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NR2E1Q9Y466 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NR2E1Q9Y466 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NR2E1Q9Y466 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NR2E1Q9Y466 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NR2E1Q9Y466 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
NR2E1Q9Y466 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NR2E1Q9Y466 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NR2E1Q9Y466 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NR2E1Q9Y466 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NR2E1Q9Y466 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NR2E1Q9Y466 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NR2E1Q9Y466 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NR2E1Q9Y466 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NR2E1Q9Y466 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NR2E1Q9Y466 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NR2E1Q9Y466 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NR2E1Q9Y466 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NR2E1Q9Y466 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NR2E1Q9Y466 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NR2E1Q9Y466 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NR2E1Q9Y466 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NR2E1Q9Y466 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NR2E1Q9Y466 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NR2E1Q9Y466 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NR2E1Q9Y466 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NR2E1Q9Y466 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NR2E1Q9Y466 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NR2E1Q9Y466 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NR2E1Q9Y466 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NR2E1Q9Y466 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NR2E1Q9Y466 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NR2E1Q9Y466 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NR2E1Q9Y466 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms