Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDD3Q9Y3P4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDD3Q9Y3P4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDD3Q9Y3P4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDD3Q9Y3P4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDD3Q9Y3P4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDD3Q9Y3P4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDD3Q9Y3P4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RHBDD3Q9Y3P4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RHBDD3Q9Y3P4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDD3Q9Y3P4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDD3Q9Y3P4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDD3Q9Y3P4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDD3Q9Y3P4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDD3Q9Y3P4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RHBDD3Q9Y3P4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RHBDD3Q9Y3P4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.33■■□□□ 1
RHBDD3Q9Y3P4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDD3Q9Y3P4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDD3Q9Y3P4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDD3Q9Y3P4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDD3Q9Y3P4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDD3Q9Y3P4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDD3Q9Y3P4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDD3Q9Y3P4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDD3Q9Y3P4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDD3Q9Y3P4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDD3Q9Y3P4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDD3Q9Y3P4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHBDD3Q9Y3P4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHBDD3Q9Y3P4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHBDD3Q9Y3P4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHBDD3Q9Y3P4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHBDD3Q9Y3P4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RHBDD3Q9Y3P4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHBDD3Q9Y3P4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RHBDD3Q9Y3P4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
RHBDD3Q9Y3P4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHBDD3Q9Y3P4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RHBDD3Q9Y3P4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RHBDD3Q9Y3P4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHBDD3Q9Y3P4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RHBDD3Q9Y3P4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RHBDD3Q9Y3P4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RHBDD3Q9Y3P4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RHBDD3Q9Y3P4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHBDD3Q9Y3P4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHBDD3Q9Y3P4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RHBDD3Q9Y3P4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHBDD3Q9Y3P4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHBDD3Q9Y3P4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHBDD3Q9Y3P4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHBDD3Q9Y3P4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RHBDD3Q9Y3P4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
RHBDD3Q9Y3P4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RHBDD3Q9Y3P4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHBDD3Q9Y3P4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHBDD3Q9Y3P4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RHBDD3Q9Y3P4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHBDD3Q9Y3P4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RHBDD3Q9Y3P4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RHBDD3Q9Y3P4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RHBDD3Q9Y3P4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RHBDD3Q9Y3P4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHBDD3Q9Y3P4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHBDD3Q9Y3P4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHBDD3Q9Y3P4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHBDD3Q9Y3P4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RHBDD3Q9Y3P4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHBDD3Q9Y3P4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHBDD3Q9Y3P4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RHBDD3Q9Y3P4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHBDD3Q9Y3P4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHBDD3Q9Y3P4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHBDD3Q9Y3P4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHBDD3Q9Y3P4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHBDD3Q9Y3P4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHBDD3Q9Y3P4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHBDD3Q9Y3P4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHBDD3Q9Y3P4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHBDD3Q9Y3P4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHBDD3Q9Y3P4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHBDD3Q9Y3P4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RHBDD3Q9Y3P4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHBDD3Q9Y3P4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHBDD3Q9Y3P4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHBDD3Q9Y3P4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHBDD3Q9Y3P4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHBDD3Q9Y3P4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RHBDD3Q9Y3P4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHBDD3Q9Y3P4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHBDD3Q9Y3P4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHBDD3Q9Y3P4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHBDD3Q9Y3P4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHBDD3Q9Y3P4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHBDD3Q9Y3P4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHBDD3Q9Y3P4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHBDD3Q9Y3P4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHBDD3Q9Y3P4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHBDD3Q9Y3P4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms