Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAB39Q9Y376 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAB39Q9Y376 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAB39Q9Y376 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAB39Q9Y376 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAB39Q9Y376 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAB39Q9Y376 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CAB39Q9Y376 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAB39Q9Y376 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAB39Q9Y376 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAB39Q9Y376 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAB39Q9Y376 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAB39Q9Y376 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAB39Q9Y376 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAB39Q9Y376 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAB39Q9Y376 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAB39Q9Y376 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAB39Q9Y376 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAB39Q9Y376 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAB39Q9Y376 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAB39Q9Y376 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAB39Q9Y376 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAB39Q9Y376 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAB39Q9Y376 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAB39Q9Y376 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAB39Q9Y376 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAB39Q9Y376 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAB39Q9Y376 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CAB39Q9Y376 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAB39Q9Y376 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAB39Q9Y376 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAB39Q9Y376 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAB39Q9Y376 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAB39Q9Y376 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAB39Q9Y376 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAB39Q9Y376 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAB39Q9Y376 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAB39Q9Y376 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAB39Q9Y376 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAB39Q9Y376 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAB39Q9Y376 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAB39Q9Y376 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CAB39Q9Y376 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAB39Q9Y376 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAB39Q9Y376 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAB39Q9Y376 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAB39Q9Y376 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CAB39Q9Y376 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAB39Q9Y376 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAB39Q9Y376 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAB39Q9Y376 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAB39Q9Y376 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAB39Q9Y376 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAB39Q9Y376 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAB39Q9Y376 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAB39Q9Y376 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAB39Q9Y376 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAB39Q9Y376 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAB39Q9Y376 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CAB39Q9Y376 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAB39Q9Y376 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAB39Q9Y376 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAB39Q9Y376 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAB39Q9Y376 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAB39Q9Y376 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAB39Q9Y376 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAB39Q9Y376 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAB39Q9Y376 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAB39Q9Y376 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAB39Q9Y376 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAB39Q9Y376 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAB39Q9Y376 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAB39Q9Y376 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAB39Q9Y376 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAB39Q9Y376 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CAB39Q9Y376 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAB39Q9Y376 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAB39Q9Y376 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAB39Q9Y376 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CAB39Q9Y376 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CAB39Q9Y376 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAB39Q9Y376 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAB39Q9Y376 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAB39Q9Y376 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAB39Q9Y376 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAB39Q9Y376 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAB39Q9Y376 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAB39Q9Y376 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAB39Q9Y376 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAB39Q9Y376 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAB39Q9Y376 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAB39Q9Y376 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAB39Q9Y376 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CAB39Q9Y376 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAB39Q9Y376 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAB39Q9Y376 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAB39Q9Y376 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CAB39Q9Y376 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAB39Q9Y376 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAB39Q9Y376 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms