Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MED16Q9Y2X0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MED16Q9Y2X0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MED16Q9Y2X0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MED16Q9Y2X0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MED16Q9Y2X0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MED16Q9Y2X0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MED16Q9Y2X0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MED16Q9Y2X0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MED16Q9Y2X0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MED16Q9Y2X0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MED16Q9Y2X0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MED16Q9Y2X0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MED16Q9Y2X0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MED16Q9Y2X0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MED16Q9Y2X0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MED16Q9Y2X0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MED16Q9Y2X0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MED16Q9Y2X0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MED16Q9Y2X0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MED16Q9Y2X0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MED16Q9Y2X0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MED16Q9Y2X0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MED16Q9Y2X0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MED16Q9Y2X0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MED16Q9Y2X0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MED16Q9Y2X0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MED16Q9Y2X0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MED16Q9Y2X0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MED16Q9Y2X0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MED16Q9Y2X0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MED16Q9Y2X0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MED16Q9Y2X0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MED16Q9Y2X0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MED16Q9Y2X0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MED16Q9Y2X0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MED16Q9Y2X0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MED16Q9Y2X0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MED16Q9Y2X0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MED16Q9Y2X0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MED16Q9Y2X0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MED16Q9Y2X0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MED16Q9Y2X0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MED16Q9Y2X0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MED16Q9Y2X0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MED16Q9Y2X0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MED16Q9Y2X0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MED16Q9Y2X0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MED16Q9Y2X0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MED16Q9Y2X0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MED16Q9Y2X0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MED16Q9Y2X0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MED16Q9Y2X0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MED16Q9Y2X0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MED16Q9Y2X0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MED16Q9Y2X0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MED16Q9Y2X0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MED16Q9Y2X0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MED16Q9Y2X0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MED16Q9Y2X0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MED16Q9Y2X0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MED16Q9Y2X0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MED16Q9Y2X0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MED16Q9Y2X0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MED16Q9Y2X0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MED16Q9Y2X0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MED16Q9Y2X0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MED16Q9Y2X0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MED16Q9Y2X0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MED16Q9Y2X0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MED16Q9Y2X0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MED16Q9Y2X0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MED16Q9Y2X0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MED16Q9Y2X0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MED16Q9Y2X0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MED16Q9Y2X0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MED16Q9Y2X0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MED16Q9Y2X0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MED16Q9Y2X0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MED16Q9Y2X0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MED16Q9Y2X0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MED16Q9Y2X0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MED16Q9Y2X0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MED16Q9Y2X0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MED16Q9Y2X0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MED16Q9Y2X0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MED16Q9Y2X0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MED16Q9Y2X0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MED16Q9Y2X0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MED16Q9Y2X0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MED16Q9Y2X0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MED16Q9Y2X0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MED16Q9Y2X0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MED16Q9Y2X0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MED16Q9Y2X0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MED16Q9Y2X0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MED16Q9Y2X0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MED16Q9Y2X0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MED16Q9Y2X0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MED16Q9Y2X0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms