Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I7

PIKFYVE, 1-phosphatidylinositol 3-phosphate 5-kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIKFYVEQ9Y2I7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIKFYVEQ9Y2I7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIKFYVEQ9Y2I7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIKFYVEQ9Y2I7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIKFYVEQ9Y2I7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIKFYVEQ9Y2I7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIKFYVEQ9Y2I7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIKFYVEQ9Y2I7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIKFYVEQ9Y2I7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PIKFYVEQ9Y2I7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIKFYVEQ9Y2I7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIKFYVEQ9Y2I7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PIKFYVEQ9Y2I7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIKFYVEQ9Y2I7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIKFYVEQ9Y2I7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIKFYVEQ9Y2I7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIKFYVEQ9Y2I7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PIKFYVEQ9Y2I7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIKFYVEQ9Y2I7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIKFYVEQ9Y2I7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIKFYVEQ9Y2I7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIKFYVEQ9Y2I7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIKFYVEQ9Y2I7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIKFYVEQ9Y2I7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIKFYVEQ9Y2I7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIKFYVEQ9Y2I7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIKFYVEQ9Y2I7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIKFYVEQ9Y2I7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIKFYVEQ9Y2I7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIKFYVEQ9Y2I7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PIKFYVEQ9Y2I7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIKFYVEQ9Y2I7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PIKFYVEQ9Y2I7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIKFYVEQ9Y2I7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIKFYVEQ9Y2I7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIKFYVEQ9Y2I7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIKFYVEQ9Y2I7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIKFYVEQ9Y2I7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIKFYVEQ9Y2I7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIKFYVEQ9Y2I7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PIKFYVEQ9Y2I7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIKFYVEQ9Y2I7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIKFYVEQ9Y2I7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIKFYVEQ9Y2I7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIKFYVEQ9Y2I7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIKFYVEQ9Y2I7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PIKFYVEQ9Y2I7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIKFYVEQ9Y2I7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIKFYVEQ9Y2I7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIKFYVEQ9Y2I7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIKFYVEQ9Y2I7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIKFYVEQ9Y2I7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIKFYVEQ9Y2I7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIKFYVEQ9Y2I7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIKFYVEQ9Y2I7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIKFYVEQ9Y2I7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIKFYVEQ9Y2I7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIKFYVEQ9Y2I7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIKFYVEQ9Y2I7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIKFYVEQ9Y2I7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIKFYVEQ9Y2I7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIKFYVEQ9Y2I7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIKFYVEQ9Y2I7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIKFYVEQ9Y2I7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIKFYVEQ9Y2I7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIKFYVEQ9Y2I7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIKFYVEQ9Y2I7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIKFYVEQ9Y2I7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIKFYVEQ9Y2I7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIKFYVEQ9Y2I7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIKFYVEQ9Y2I7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIKFYVEQ9Y2I7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIKFYVEQ9Y2I7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIKFYVEQ9Y2I7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIKFYVEQ9Y2I7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIKFYVEQ9Y2I7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIKFYVEQ9Y2I7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIKFYVEQ9Y2I7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIKFYVEQ9Y2I7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIKFYVEQ9Y2I7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
PIKFYVEQ9Y2I7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIKFYVEQ9Y2I7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIKFYVEQ9Y2I7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIKFYVEQ9Y2I7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIKFYVEQ9Y2I7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIKFYVEQ9Y2I7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIKFYVEQ9Y2I7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIKFYVEQ9Y2I7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIKFYVEQ9Y2I7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIKFYVEQ9Y2I7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIKFYVEQ9Y2I7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIKFYVEQ9Y2I7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIKFYVEQ9Y2I7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIKFYVEQ9Y2I7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIKFYVEQ9Y2I7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PIKFYVEQ9Y2I7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIKFYVEQ9Y2I7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIKFYVEQ9Y2I7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIKFYVEQ9Y2I7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIKFYVEQ9Y2I7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms