Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SBNO2Q9Y2G9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SBNO2Q9Y2G9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SBNO2Q9Y2G9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SBNO2Q9Y2G9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SBNO2Q9Y2G9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SBNO2Q9Y2G9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SBNO2Q9Y2G9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SBNO2Q9Y2G9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SBNO2Q9Y2G9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
SBNO2Q9Y2G9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SBNO2Q9Y2G9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SBNO2Q9Y2G9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SBNO2Q9Y2G9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SBNO2Q9Y2G9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
SBNO2Q9Y2G9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SBNO2Q9Y2G9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SBNO2Q9Y2G9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SBNO2Q9Y2G9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SBNO2Q9Y2G9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SBNO2Q9Y2G9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SBNO2Q9Y2G9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SBNO2Q9Y2G9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SBNO2Q9Y2G9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SBNO2Q9Y2G9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SBNO2Q9Y2G9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SBNO2Q9Y2G9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SBNO2Q9Y2G9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SBNO2Q9Y2G9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
SBNO2Q9Y2G9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SBNO2Q9Y2G9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
SBNO2Q9Y2G9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SBNO2Q9Y2G9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SBNO2Q9Y2G9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SBNO2Q9Y2G9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SBNO2Q9Y2G9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SBNO2Q9Y2G9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SBNO2Q9Y2G9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SBNO2Q9Y2G9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SBNO2Q9Y2G9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SBNO2Q9Y2G9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.08
SBNO2Q9Y2G9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
SBNO2Q9Y2G9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
SBNO2Q9Y2G9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
SBNO2Q9Y2G9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
SBNO2Q9Y2G9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
SBNO2Q9Y2G9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
SBNO2Q9Y2G9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
SBNO2Q9Y2G9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
SBNO2Q9Y2G9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SBNO2Q9Y2G9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SBNO2Q9Y2G9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SBNO2Q9Y2G9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SBNO2Q9Y2G9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SBNO2Q9Y2G9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SBNO2Q9Y2G9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SBNO2Q9Y2G9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SBNO2Q9Y2G9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SBNO2Q9Y2G9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SBNO2Q9Y2G9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SBNO2Q9Y2G9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SBNO2Q9Y2G9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SBNO2Q9Y2G9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
SBNO2Q9Y2G9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SBNO2Q9Y2G9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SBNO2Q9Y2G9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SBNO2Q9Y2G9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SBNO2Q9Y2G9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
SBNO2Q9Y2G9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SBNO2Q9Y2G9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SBNO2Q9Y2G9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SBNO2Q9Y2G9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
SBNO2Q9Y2G9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
SBNO2Q9Y2G9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SBNO2Q9Y2G9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SBNO2Q9Y2G9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SBNO2Q9Y2G9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SBNO2Q9Y2G9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SBNO2Q9Y2G9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
SBNO2Q9Y2G9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SBNO2Q9Y2G9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SBNO2Q9Y2G9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SBNO2Q9Y2G9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SBNO2Q9Y2G9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SBNO2Q9Y2G9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SBNO2Q9Y2G9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
SBNO2Q9Y2G9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SBNO2Q9Y2G9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SBNO2Q9Y2G9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SBNO2Q9Y2G9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SBNO2Q9Y2G9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SBNO2Q9Y2G9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SBNO2Q9Y2G9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SBNO2Q9Y2G9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SBNO2Q9Y2G9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SBNO2Q9Y2G9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SBNO2Q9Y2G9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SBNO2Q9Y2G9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SBNO2Q9Y2G9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SBNO2Q9Y2G9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms