Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQN3

CHMP2B, Charged multivesicular body protein 2b, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2BQ9UQN3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMP2BQ9UQN3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMP2BQ9UQN3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMP2BQ9UQN3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMP2BQ9UQN3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMP2BQ9UQN3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMP2BQ9UQN3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMP2BQ9UQN3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMP2BQ9UQN3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMP2BQ9UQN3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMP2BQ9UQN3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMP2BQ9UQN3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMP2BQ9UQN3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CHMP2BQ9UQN3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CHMP2BQ9UQN3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP2BQ9UQN3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP2BQ9UQN3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP2BQ9UQN3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP2BQ9UQN3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP2BQ9UQN3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP2BQ9UQN3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP2BQ9UQN3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP2BQ9UQN3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP2BQ9UQN3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP2BQ9UQN3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP2BQ9UQN3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP2BQ9UQN3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP2BQ9UQN3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP2BQ9UQN3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP2BQ9UQN3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP2BQ9UQN3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMP2BQ9UQN3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMP2BQ9UQN3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMP2BQ9UQN3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMP2BQ9UQN3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMP2BQ9UQN3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMP2BQ9UQN3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMP2BQ9UQN3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP2BQ9UQN3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP2BQ9UQN3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP2BQ9UQN3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP2BQ9UQN3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP2BQ9UQN3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP2BQ9UQN3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP2BQ9UQN3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP2BQ9UQN3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP2BQ9UQN3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP2BQ9UQN3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP2BQ9UQN3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP2BQ9UQN3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP2BQ9UQN3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP2BQ9UQN3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP2BQ9UQN3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP2BQ9UQN3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP2BQ9UQN3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP2BQ9UQN3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP2BQ9UQN3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP2BQ9UQN3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP2BQ9UQN3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP2BQ9UQN3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP2BQ9UQN3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP2BQ9UQN3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP2BQ9UQN3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP2BQ9UQN3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP2BQ9UQN3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP2BQ9UQN3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP2BQ9UQN3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP2BQ9UQN3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP2BQ9UQN3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP2BQ9UQN3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP2BQ9UQN3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP2BQ9UQN3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMP2BQ9UQN3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMP2BQ9UQN3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMP2BQ9UQN3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMP2BQ9UQN3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMP2BQ9UQN3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMP2BQ9UQN3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP2BQ9UQN3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP2BQ9UQN3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP2BQ9UQN3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP2BQ9UQN3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP2BQ9UQN3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP2BQ9UQN3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP2BQ9UQN3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP2BQ9UQN3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP2BQ9UQN3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP2BQ9UQN3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMP2BQ9UQN3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMP2BQ9UQN3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMP2BQ9UQN3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMP2BQ9UQN3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMP2BQ9UQN3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMP2BQ9UQN3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMP2BQ9UQN3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMP2BQ9UQN3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP2BQ9UQN3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP2BQ9UQN3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP2BQ9UQN3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP2BQ9UQN3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms