Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ88

CDK11A, Cyclin-dependent kinase 11A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11AQ9UQ88 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
CDK11AQ9UQ88 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
CDK11AQ9UQ88 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
CDK11AQ9UQ88 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
CDK11AQ9UQ88 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
CDK11AQ9UQ88 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
CDK11AQ9UQ88 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
CDK11AQ9UQ88 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
CDK11AQ9UQ88 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.5■■■■□ 3.75
CDK11AQ9UQ88 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CDK11AQ9UQ88 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CDK11AQ9UQ88 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CDK11AQ9UQ88 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
CDK11AQ9UQ88 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CDK11AQ9UQ88 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CDK11AQ9UQ88 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CDK11AQ9UQ88 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CDK11AQ9UQ88 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
CDK11AQ9UQ88 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
CDK11AQ9UQ88 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
CDK11AQ9UQ88 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC38.46■■■■□ 3.75
CDK11AQ9UQ88 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
CDK11AQ9UQ88 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
CDK11AQ9UQ88 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
CDK11AQ9UQ88 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
CDK11AQ9UQ88 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC38.45■■■■□ 3.75
CDK11AQ9UQ88 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
CDK11AQ9UQ88 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
CDK11AQ9UQ88 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
CDK11AQ9UQ88 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
CDK11AQ9UQ88 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
CDK11AQ9UQ88 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
CDK11AQ9UQ88 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
CDK11AQ9UQ88 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
CDK11AQ9UQ88 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC38.43■■■■□ 3.74
CDK11AQ9UQ88 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
CDK11AQ9UQ88 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
CDK11AQ9UQ88 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CDK11AQ9UQ88 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CDK11AQ9UQ88 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CDK11AQ9UQ88 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
CDK11AQ9UQ88 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
CDK11AQ9UQ88 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
CDK11AQ9UQ88 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
CDK11AQ9UQ88 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.73
CDK11AQ9UQ88 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
CDK11AQ9UQ88 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
CDK11AQ9UQ88 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
CDK11AQ9UQ88 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
CDK11AQ9UQ88 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
CDK11AQ9UQ88 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
CDK11AQ9UQ88 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CDK11AQ9UQ88 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CDK11AQ9UQ88 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CDK11AQ9UQ88 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
CDK11AQ9UQ88 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC38.35■■■■□ 3.73
CDK11AQ9UQ88 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CDK11AQ9UQ88 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
CDK11AQ9UQ88 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
CDK11AQ9UQ88 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
CDK11AQ9UQ88 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
CDK11AQ9UQ88 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
CDK11AQ9UQ88 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
CDK11AQ9UQ88 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
CDK11AQ9UQ88 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC38.32■■■■□ 3.73
CDK11AQ9UQ88 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC38.32■■■■□ 3.72
CDK11AQ9UQ88 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
CDK11AQ9UQ88 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
CDK11AQ9UQ88 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.72
CDK11AQ9UQ88 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
CDK11AQ9UQ88 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
CDK11AQ9UQ88 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
CDK11AQ9UQ88 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
CDK11AQ9UQ88 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.72
CDK11AQ9UQ88 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
CDK11AQ9UQ88 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.72
CDK11AQ9UQ88 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
CDK11AQ9UQ88 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
CDK11AQ9UQ88 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
CDK11AQ9UQ88 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
CDK11AQ9UQ88 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
CDK11AQ9UQ88 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
CDK11AQ9UQ88 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CDK11AQ9UQ88 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
CDK11AQ9UQ88 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CDK11AQ9UQ88 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CDK11AQ9UQ88 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
CDK11AQ9UQ88 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
CDK11AQ9UQ88 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
CDK11AQ9UQ88 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
CDK11AQ9UQ88 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.27■■■■□ 3.72
CDK11AQ9UQ88 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.27■■■■□ 3.72
CDK11AQ9UQ88 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
CDK11AQ9UQ88 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC38.27■■■■□ 3.72
CDK11AQ9UQ88 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
CDK11AQ9UQ88 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
CDK11AQ9UQ88 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
CDK11AQ9UQ88 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
CDK11AQ9UQ88 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
CDK11AQ9UQ88 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms