Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMG5Q9UPR3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMG5Q9UPR3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMG5Q9UPR3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMG5Q9UPR3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMG5Q9UPR3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMG5Q9UPR3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMG5Q9UPR3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMG5Q9UPR3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMG5Q9UPR3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMG5Q9UPR3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMG5Q9UPR3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMG5Q9UPR3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMG5Q9UPR3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMG5Q9UPR3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMG5Q9UPR3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMG5Q9UPR3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMG5Q9UPR3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SMG5Q9UPR3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SMG5Q9UPR3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SMG5Q9UPR3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMG5Q9UPR3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMG5Q9UPR3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMG5Q9UPR3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMG5Q9UPR3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMG5Q9UPR3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMG5Q9UPR3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMG5Q9UPR3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMG5Q9UPR3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMG5Q9UPR3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMG5Q9UPR3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMG5Q9UPR3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMG5Q9UPR3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMG5Q9UPR3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMG5Q9UPR3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SMG5Q9UPR3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMG5Q9UPR3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SMG5Q9UPR3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMG5Q9UPR3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMG5Q9UPR3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMG5Q9UPR3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SMG5Q9UPR3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMG5Q9UPR3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMG5Q9UPR3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMG5Q9UPR3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMG5Q9UPR3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMG5Q9UPR3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMG5Q9UPR3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SMG5Q9UPR3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SMG5Q9UPR3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SMG5Q9UPR3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMG5Q9UPR3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMG5Q9UPR3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMG5Q9UPR3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SMG5Q9UPR3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMG5Q9UPR3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SMG5Q9UPR3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMG5Q9UPR3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMG5Q9UPR3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMG5Q9UPR3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMG5Q9UPR3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMG5Q9UPR3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMG5Q9UPR3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMG5Q9UPR3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMG5Q9UPR3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMG5Q9UPR3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMG5Q9UPR3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMG5Q9UPR3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMG5Q9UPR3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMG5Q9UPR3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMG5Q9UPR3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMG5Q9UPR3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMG5Q9UPR3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMG5Q9UPR3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMG5Q9UPR3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SMG5Q9UPR3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMG5Q9UPR3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMG5Q9UPR3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMG5Q9UPR3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMG5Q9UPR3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMG5Q9UPR3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMG5Q9UPR3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMG5Q9UPR3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMG5Q9UPR3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMG5Q9UPR3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMG5Q9UPR3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMG5Q9UPR3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMG5Q9UPR3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMG5Q9UPR3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SMG5Q9UPR3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMG5Q9UPR3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMG5Q9UPR3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMG5Q9UPR3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMG5Q9UPR3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMG5Q9UPR3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMG5Q9UPR3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMG5Q9UPR3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMG5Q9UPR3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMG5Q9UPR3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SMG5Q9UPR3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms