Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP52

TFR2, Transferrin receptor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFR2Q9UP52 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TFR2Q9UP52 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TFR2Q9UP52 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TFR2Q9UP52 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TFR2Q9UP52 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TFR2Q9UP52 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TFR2Q9UP52 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TFR2Q9UP52 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TFR2Q9UP52 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TFR2Q9UP52 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TFR2Q9UP52 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TFR2Q9UP52 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TFR2Q9UP52 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TFR2Q9UP52 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TFR2Q9UP52 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TFR2Q9UP52 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TFR2Q9UP52 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TFR2Q9UP52 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TFR2Q9UP52 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TFR2Q9UP52 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TFR2Q9UP52 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TFR2Q9UP52 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TFR2Q9UP52 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TFR2Q9UP52 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TFR2Q9UP52 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TFR2Q9UP52 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TFR2Q9UP52 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TFR2Q9UP52 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TFR2Q9UP52 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TFR2Q9UP52 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TFR2Q9UP52 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TFR2Q9UP52 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TFR2Q9UP52 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TFR2Q9UP52 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TFR2Q9UP52 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TFR2Q9UP52 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TFR2Q9UP52 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TFR2Q9UP52 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TFR2Q9UP52 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TFR2Q9UP52 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TFR2Q9UP52 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TFR2Q9UP52 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TFR2Q9UP52 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TFR2Q9UP52 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TFR2Q9UP52 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TFR2Q9UP52 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TFR2Q9UP52 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TFR2Q9UP52 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TFR2Q9UP52 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TFR2Q9UP52 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TFR2Q9UP52 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TFR2Q9UP52 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TFR2Q9UP52 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TFR2Q9UP52 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TFR2Q9UP52 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TFR2Q9UP52 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TFR2Q9UP52 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TFR2Q9UP52 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TFR2Q9UP52 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TFR2Q9UP52 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TFR2Q9UP52 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TFR2Q9UP52 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TFR2Q9UP52 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TFR2Q9UP52 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TFR2Q9UP52 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TFR2Q9UP52 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TFR2Q9UP52 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TFR2Q9UP52 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TFR2Q9UP52 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TFR2Q9UP52 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TFR2Q9UP52 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TFR2Q9UP52 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TFR2Q9UP52 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TFR2Q9UP52 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TFR2Q9UP52 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TFR2Q9UP52 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TFR2Q9UP52 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TFR2Q9UP52 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TFR2Q9UP52 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TFR2Q9UP52 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TFR2Q9UP52 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TFR2Q9UP52 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TFR2Q9UP52 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TFR2Q9UP52 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TFR2Q9UP52 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TFR2Q9UP52 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TFR2Q9UP52 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TFR2Q9UP52 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TFR2Q9UP52 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TFR2Q9UP52 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TFR2Q9UP52 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TFR2Q9UP52 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TFR2Q9UP52 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TFR2Q9UP52 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TFR2Q9UP52 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TFR2Q9UP52 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TFR2Q9UP52 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TFR2Q9UP52 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TFR2Q9UP52 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TFR2Q9UP52 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms